Ajdukiewicz sinh năm 1890 tại Tarnopol ở Galicia, vùng bị Đế quốc Áo-Hung sáp nhập khi phân chia Ba Lan. Cha là một công chức cao cấp. Ajdukiewicz học tại Đại học Lwów và giảng dạy ở đó. Ông cũng làm giảng viên tại Warszawa và Poznań. Ông nhận bằng tiến sĩ với luận án về triết lý không gian Kant. Từ 1948 đến 1952, ông là Hiệu trưởng trường Đại học Poznań. Từ năm 1953, ông là một trong những người sáng lập tạp chí Studia Logica, cống hiến cho tạp chí đến khi qua đời.